Stage M1S2 (2020-2021)
Bonjour,
Merci de déposer votre proposition de stage pour les M1S2 BSIB.
Le stage se déroulera sur 7 semaines en mars/avril 2021.
Responsable de l'équipe d'accueil
Poch
Olivier
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03 68 85 32 95
Personne encadrant le stage
Lecompte
Odile
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03 68 85 32 96
Lieu du stage
Centre de Recherche en Biomédecine de Strasbourg
ICube/UMR7357, CSTB
1 Rue Eugène Boeckel
67000 Strasbourg
ICube/UMR7357, CSTB
1 Rue Eugène Boeckel
67000 Strasbourg
Sujet du stage
Etude des éléments transposables présents chez les Crustacés
Les éléments transposables peuvent constituer une part importante des génomes chez les Métazoaires (près de la moitié du génome humain). Ils constituent des éléments clés de la plasticité génomique. Chez les Insectes, le contenu en éléments transposables apparait très variable suivant les espèces considérées et contribuent grandement aux variations de taille de génomes observées (WU & Lu, Genes, 2019). En revanche, on ne dispose encore que de peu de données sur les éléments transposables chez les Crustacés.
L’objectif du stage est de constituer un ensemble de référence de ces éléments répétés chez les Crustacés afin d’étudier leur évolution. Pour cela, il conviendra dans un premier temps de recenser les transposons déjà décrits dans la littérature et les bases de données. Dans un deuxième temps, les génomes et transcriptomes de quelques espèces représentatives de Crustacés seront explorés pour rechercher de nouveaux transposons. Les contenus en transposons connus et nouveaux des espèces ciblées seront ensuite comparés afin de caractériser l’évolution des transposons chez les Crustacés et l’impact de ces derniers sur les caractéristiques génomiques.
L’objectif du stage est de constituer un ensemble de référence de ces éléments répétés chez les Crustacés afin d’étudier leur évolution. Pour cela, il conviendra dans un premier temps de recenser les transposons déjà décrits dans la littérature et les bases de données. Dans un deuxième temps, les génomes et transcriptomes de quelques espèces représentatives de Crustacés seront explorés pour rechercher de nouveaux transposons. Les contenus en transposons connus et nouveaux des espèces ciblées seront ensuite comparés afin de caractériser l’évolution des transposons chez les Crustacés et l’impact de ces derniers sur les caractéristiques génomiques.
Descriptif
L'étudiant intègre pendant cette période une équipe de recherche. Sous le contrôle d’un tuteur pédagogique, l'étudiant s’initiera au travail quotidien d’un chercheur en suivant les travaux d’une équipe de recherche. Un projet pédagogique simple avec des objectifs à court-terme lui sera proposé afin de se familiariser avec une méthode et/ou une technique parmi celle utilisées dans le domaine. Ce stage pourra aussi être constitué par un travail bibliographique.
Objectifs en termes de compétences
- Se forger une vision des problématiques et de défis de la discipline,
- S’initier et découvrir la pensée et la démarche scientifique : les moyens humains et techniques pour répondre à une question biologique,
- Découvrir les laboratoires associés au master. Utiliser les méthodes et les techniques les plus performantes,
- Appréhender la vie quotidienne d’une équipe de recherche,
- Apprendre à travailler en équipe,
- Développer un regard critique sur un article de recherche,
- Apprendre à écrire et à structurer un rapport, à tenir un cahier de laboratoire, à faire une présentation orale.
Le contrôle des connaissances du stage en laboratoire
- un rapport écrit. A rendre pour avril/mai 2021
- une présentation orale( en mai 2021)
- exposé oral
- réponses aux questions