Stage M2S3 (2020-2021)

Bonjour,

Merci de déposer votre proposition de stage pour le M2S3 BSIB 2020-2021.

Le stage se déroulera du entre novembre et décembre 2020 (4 semaines).

Ce stage peut-être adossé au stage de M2S4.

Responsable de l'équipe d'accueil

LEIZE
Emmanuelle
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03 68 85 16 26

Personne encadrant le stage

POTIER
Noelle
03 68 85 16 41

Lieu du stage

Laboratoire de Spectrométrie de Masse des Interactions et des Systèmes
UMR7140 - 4 rue Blaise Pascal
67081 Strasbourg

Sujet du stage

Evaluation et comparaison de trois logiciels d'interprétation de données obtenues par couplage cross-link / Spectrométrie de Masse (XLMS)
Dans le cadre de l'analyse structurale des protéines ou complexes protéiques, une approche basée sur la spectrométrie de masse couplée à une technique de pontage chimique covalent (cross-link) est actuellement développée. Cette approche permet d'obtenir des informations expérimentales de contraintes de distances qui permettront d'affiner les modèles structuraux proposés par d'autres techniques analytiques telles que la modélisation moléculaire ou la microscopie électronique. L'interprétation des données nécessite encore une validation manuelle des résultats, longue et subjective. Afin de rendre cette étape d'identification plus reproductible, trois logiciels open-source ont été choisi pour une étude comparative et la mise en place d'un protocole de requête optimisé pour les données de XLMS.

"Mini-Stage en laboratoire" : 9 ECTS.

 

Descriptif

L'étudiant intègre pendant cette période une équipe de recherche et participe sous le contrôle d'un tuteur de stage aux travaux de recherche de l'équipe.

Durée : 4 semaines, temps complet.

 

Compétences visées

Connaissance par la pratique du métier de chercheur. Comprendre une stratégie de recherche et les solutions proposées. Mise en pratique des connaissances acquises en situation réelle.


Le contrôle des connaissances

Le contrôle des connaissances pour cette UE comporte 2 aspects :

  • un rapport écrit (coefficient 2) (date de remise décembre 2020)
  • une présentation orale (décembre 2020), la date sera précisée :
       - exposé oral (coefficient 4)
       - réponses aux questions (coefficient 3)