Stage M2S3 (2020-2021)
Bonjour,
Merci de déposer votre proposition de stage pour le M2S3 BSIB 2020-2021.
Le stage se déroulera du entre novembre et décembre 2020 (4 semaines).
Ce stage peut-être adossé au stage de M2S4.
Responsable de l'équipe d'accueil
Kieffer
Bruno
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03 68 85 47 22
Personne encadrant le stage
Deville
Célia
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03 68 85 47 25
Lieu du stage
IGBMC
Sujet du stage
Caractérisation structurale de la régulation du récepteur des androgènes
Mots Clés : biologie structurale, transcription, IDP, chaperonnes, RMN, cryoEM
Contexte : Le récepteur des androgènes (AR) est un facteur de transcription impliqué dans le développement et le maintien du phénotype male, et de nombreux autres processus chez les deux sexes, comme la régulation de la masse musculaire ou de la densité osseuse. Il joue également un rôle clé dans le développement du cancer de la prostate et dans l’évolution de cette maladie vers une forme résistante aux thérapies chimiques via l’apparition de formes mutées (variants) du récepteur.
AR est activé lors de l’interaction avec des hormones androgènes. Mais son action est également modulée par de nombreux co-activateurs, chaperonnes, modifications post-traductionelles ciblant notamment la région N-terminale intrinsèquement désordonnée du récepteur.
Notre équipe caractérise les mécanismes de régulation du récepteur en combinant des approches moléculaire de biophysique et de biologie structurale et une caractérisation fonctionnelle à l’échelle cellulaire de variants pathologiques de AR impliqués dans les processus tumoraux.
Projet : L’objectif de ce projet est la caractérisation structurale de l’interaction entre AR et différents co-régulateurs pour mieux comprendre leur rôle dans la modulation de l’activité de AR. Nous avons déjà mis en place des protocoles d’expression et purification de domaines de AR et de protéine partenaires. La caractérisation des interactions se fera par combinaison de plusieurs approches structurales et biophysiques : RMN pour des fragments impliquant des régions dynamiques et cryoEM pour l’étude de complexes impliquant la protéine entière.
Techniques :
- production et purification de protéines, marquage isotopique
- RMN : analyse de spectres, attribution des signaux, caractérisation des interactions protéine-protéine impliquant des régions flexibles
- méthodes biophysiques : diffusion de la lumière, anisotropie de fluorescence, thermophorèse etc
- cryoEM : préparation d’échantillon et optimisation de conditions pour la formation de complexes AR:chaperonnes
Laboratoire : IGBMC, département de biologie structurale intégrative
Equipe d’accueil : Bruno Kieffer
Encadrante : Célia Deville
Contact : This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. ou This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.
Stage pouvant être poursuivi en M2S4
Contexte : Le récepteur des androgènes (AR) est un facteur de transcription impliqué dans le développement et le maintien du phénotype male, et de nombreux autres processus chez les deux sexes, comme la régulation de la masse musculaire ou de la densité osseuse. Il joue également un rôle clé dans le développement du cancer de la prostate et dans l’évolution de cette maladie vers une forme résistante aux thérapies chimiques via l’apparition de formes mutées (variants) du récepteur.
AR est activé lors de l’interaction avec des hormones androgènes. Mais son action est également modulée par de nombreux co-activateurs, chaperonnes, modifications post-traductionelles ciblant notamment la région N-terminale intrinsèquement désordonnée du récepteur.
Notre équipe caractérise les mécanismes de régulation du récepteur en combinant des approches moléculaire de biophysique et de biologie structurale et une caractérisation fonctionnelle à l’échelle cellulaire de variants pathologiques de AR impliqués dans les processus tumoraux.
Projet : L’objectif de ce projet est la caractérisation structurale de l’interaction entre AR et différents co-régulateurs pour mieux comprendre leur rôle dans la modulation de l’activité de AR. Nous avons déjà mis en place des protocoles d’expression et purification de domaines de AR et de protéine partenaires. La caractérisation des interactions se fera par combinaison de plusieurs approches structurales et biophysiques : RMN pour des fragments impliquant des régions dynamiques et cryoEM pour l’étude de complexes impliquant la protéine entière.
Techniques :
- production et purification de protéines, marquage isotopique
- RMN : analyse de spectres, attribution des signaux, caractérisation des interactions protéine-protéine impliquant des régions flexibles
- méthodes biophysiques : diffusion de la lumière, anisotropie de fluorescence, thermophorèse etc
- cryoEM : préparation d’échantillon et optimisation de conditions pour la formation de complexes AR:chaperonnes
Laboratoire : IGBMC, département de biologie structurale intégrative
Equipe d’accueil : Bruno Kieffer
Encadrante : Célia Deville
Contact : This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. ou This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.
Stage pouvant être poursuivi en M2S4
"Mini-Stage en laboratoire" : 9 ECTS.
Descriptif
L'étudiant intègre pendant cette période une équipe de recherche et participe sous le contrôle d'un tuteur de stage aux travaux de recherche de l'équipe.
Durée : 4 semaines, temps complet.
Compétences visées
Connaissance par la pratique du métier de chercheur. Comprendre une stratégie de recherche et les solutions proposées. Mise en pratique des connaissances acquises en situation réelle.
Le contrôle des connaissances
Le contrôle des connaissances pour cette UE comporte 2 aspects :
- un rapport écrit (coefficient 2) (date de remise décembre 2020)
- une présentation orale (décembre 2020), la date sera précisée :
- exposé oral (coefficient 4)
- réponses aux questions (coefficient 3)