Responsable de l'équipe d'accueil

Lamour
Valérie
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0369485281

Personne encadrant le stage

Lamour
Valérie
0369485281

Lieu du stage

IGBMC, Dept de Biologie structurale intégrative

Sujet du stage

Etude structurale de l’ADN gyrase bactérienne en complexe avec un antibiotique
Notre équipe de recherche se concentre sur les complexes nucléoprotéiques impliqués dans l'intégration de l'ADN rétroviral et des ADN topoisomérases. Ces dernières sont indispensables à la résolution des problèmes topologiques introduits dans la double hélice de l’ADN lors de la réplication, la transcription et la ségrégation des chromosomes. Ces activités essentielles dans la bactérie en font une cible privilégiée pour les molécules utilisées en antibiothérapie. La lutte contre les souches bactériennes multi-résistantes est un enjeu majeur de santé publique. L'objectif principal de nos activités est d'étudier la relation structure/fonction des complexes associés aux topoisomérases et ciblés par des médicaments. Nous combinons les techniques structurales comme la microscopie électronique, la cristallographie, les techniques biophysiques avec des tests enzymatiques et fonctionnels sur les protéines recombinantes.
Notre équipe a mis en évidence l’architecture tridimensionnelle d’un complexe de l’ADN gyrase, une topoisomérase de type 2 bactérienne, avec un ADN un antibiotique, révélant pour la première fois la structure entière de l’enzyme piégée par une quinolone par cryo-microcopie électronique (Papillon et al, Nucleic Ac. Res. 2013). Nous avons récemment résolu les structures cristallographiques du domaine ATPase de la gyrase d’organismes gram négatif en complexe avec un antibiotique de la famille des aminocoumarines. L’objectif du stage portera sur l’expression et la caractérisation structurale du domaine ATPase d’une gyrase bactérienne d’un organisme gram positif en complexe avec un antibiotique, ainsi que la comparaison des activités de la molécule sur des cultures bactériennes. L’étudiant bénéficiera de l’appui scientifique et technique avérée de l’équipe d’accueil dans ce domaine, ainsi que de l’environnement du département de biologie structurale intégrative à l’IGBMC et ses plateformes technologiques.