Stage BSIB 2022-2023
Bonjour,
Merci de déposer votre/vos proposition(s) de stage pour le master BSIB 2022-2023.
Il n'y a qu'un seul formulaire pour les 3 stages :
- en M1S2 : à définir pour 2022-2023
- en M2S3 : à définir pour 2022-2023
- en M2S4 : à définir pour 2022-2023
Nous souhaitons coupler le stage M2S3 et le stage M2S4, c'est à dire que nous souhaiterions que les 2 stages se déroulent dans la même équipe sur la même thématique. Le stage M2S3 serait donc une période de préparation du stage M2S4. Cette période de stage M2S3 pourrait alors être essentiellement un travail bibliographique et de planification. C'est une recommendation pas une obligation.
pour lire les consignes concernant les 3 stages, merci de suivre les liens ci-après : M1S2, M2S3, M2S4.
Stage Master
- Stage M1S2
- Stage M2S3
- Stage M2S4
Responsable de l'équipe d'accueil
Romier
Christophe
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0369485294
Personne encadrant le stage (*)
(*) modifiez si une autre personne encadre l'étudiant
Durand
Marie-Laure
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0369485158
Lieu du stage
1 rue Laurent Fries
67400 ILLKIRCH GRAFFENSTADEN
67400 ILLKIRCH GRAFFENSTADEN
Sujet du stage
Etude de l’architecture du complexe Cohésine et implication pour son mode d’action
L’organisation 3D du génome joue un rôle essentiel dans la régulation des mécanismes nucléaires. Un acteur essentiel de cette organisation est le complexe Cohésine qui participe à la cohésion des chromatides sœurs, la ségrégation des chromosomes, la réplication et la réparation de l’ADN, ainsi qu’à la régulation de la transcription des gènes (1). Le rôle essentiel de la Cohésine est ainsi démontré par son implication dans de nombreuses maladies qui vont de divers cancers – certaines sous-unités de la Cohésine font partie des quelques protéines les plus mutées dans un grand nombre de cancers - jusqu’aux maladies neurodéveloppementales (2, 3, 4). Il est essentiel de caractériser le mode d’action de la Cohésine pour mieux comprendre les mécanismes qui sous-tendent ses fonctions, et comment ceux-ci sont dérégulés dans les maladies. Notre équipe adresse ces questions de manière intégrative en combinant biochimie et biologie structurale mais également des études in vivo chez le poisson zèbre pour in fine permettre l’identification de candidats-médicaments.
L’architecture de la Cohésine joue un rôle un essentiel dans son fonctionnement. L’interaction du complexe avec de nombreux régulateurs au cours du cycle cellulaire ainsi que la liaison et l’hydrolyse de molécules d’ATP induisent des changements structuraux qui vont moduler le mode de liaison du complexe à l’ADN. Cependant, l’ensemble des conformations de la Cohésine ainsi que le rôle exact de la liaison/hydrolyse d’ATP et des régulateurs du complexe dans la transition entre ces différentes conformations restent à explorer.
Le projet a pour but d’analyser les différentes conformations de la Cohésine lors de la liaison et de l’hydrolyse de molécule d’ATP. Pour ce faire des techniques d’expression en cellules d’insecte, de purification de protéines, d’analyses biophysiques et structurales par cristallograhie et cryo-microscopie électronique seront employées.
1. Yatskevich et al. (2019) Annu. Rev. Genet., vol. 53, 445‑482. doi : 10.1146/annurev-genet-112618-043633.
2. Mintzas et al. (2019) Expert Op. Ther. Targ., 23, 525‑537. doi : 10.1080/14728222.2019.1609943.
3. Kline et al. (2018) Nat. Rev. Genet., 19, 649-666. doi : 10.1038/s41576-018-0031-0.
4. Mfarej et Skibbens (2020) PLoS Genet, 16, e1009219, doi : 10.1371/journal.pgen.1009219
L’architecture de la Cohésine joue un rôle un essentiel dans son fonctionnement. L’interaction du complexe avec de nombreux régulateurs au cours du cycle cellulaire ainsi que la liaison et l’hydrolyse de molécules d’ATP induisent des changements structuraux qui vont moduler le mode de liaison du complexe à l’ADN. Cependant, l’ensemble des conformations de la Cohésine ainsi que le rôle exact de la liaison/hydrolyse d’ATP et des régulateurs du complexe dans la transition entre ces différentes conformations restent à explorer.
Le projet a pour but d’analyser les différentes conformations de la Cohésine lors de la liaison et de l’hydrolyse de molécule d’ATP. Pour ce faire des techniques d’expression en cellules d’insecte, de purification de protéines, d’analyses biophysiques et structurales par cristallograhie et cryo-microscopie électronique seront employées.
1. Yatskevich et al. (2019) Annu. Rev. Genet., vol. 53, 445‑482. doi : 10.1146/annurev-genet-112618-043633.
2. Mintzas et al. (2019) Expert Op. Ther. Targ., 23, 525‑537. doi : 10.1080/14728222.2019.1609943.
3. Kline et al. (2018) Nat. Rev. Genet., 19, 649-666. doi : 10.1038/s41576-018-0031-0.
4. Mfarej et Skibbens (2020) PLoS Genet, 16, e1009219, doi : 10.1371/journal.pgen.1009219