Bonjour,

Merci de déposer votre proposition de stage pour les M1S2 BSIB.

Le stage se déroulera sur 3 semaines en mars 2019.

Responsable de l'équipe d'accueil

Poterszman
Arnaud
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03 69 48 52 90

Personne encadrant le stage

Poterszman
Arnaud
03 69 48 52 90

Lieu du stage

IGBMC
1 rue Laurent Fries
67 404 Illkirch Cedex

Sujet du stage

Etude structurale de complexes de réparation de l’ADN par excision-resynthèse de nucléotides.
L’ADN est fréquemment exposé à l’action d’évènements génotoxiques, que ce soit par des agents exogènes comme les radiations ionisantes, des molécules mutagènes ou par le métabolisme cellulaire. Différentes mécanismes cellulaires permettent l’élimination et la réparation de ces lésions. Nous travaillons sur la voie de réparation par excision-resynthèse des nucléotides (NER), plus précisément sur le facteur TFIIH, un complexe multi-protéique composé de 10 sous-unités impliqué non seulement dans la voie NER mais également dans l’initiation de la transcription et sa régulation. Impliqué dans de nombreuses voies métaboliques, il interagit avec de multiples partenaires dont les acteurs de la transcription basale et activée ainsi que des facteurs de réparation de la voie NER dont le complexe de reconnaissance de la lésion XPC/HR23B ou l’endonucléase XPG.

Le stage proposé se focalisera sur l’étude du complexe TFIIH dont 3 de ces sous-unités XPB, XPD et Cdk7 possèdent des activités enzymatiques et constituent des cibles thérapeutiques. Différentes options sont envisageables en fonction des intérêts de l’étudiant(e). Le stage pourrait porter sur l’analyse des données structurales disponibles et en particulier du complexe TFIIH sous forme libre déterminé par le groupe d’Eva Nogales (Berckeley) avec des approches bio-informatiques. Un volet expérimental permettrait à l’étudiant(e) de se familiariser avec les approches biochimiques pour la préparation du complexe TFIIH et à la mise en place d’un test hélicase pour caractériser l’activité de la sous-unité XPD. Ces travaux s’inscrivent dans le cadre des travaux menés au laboratoire qui combinent des approches biochimiques, biophysiques et structurales pour étudier mieux comprendre les mécanismes de réparation de l’ADN.

Descriptif

L'étudiant intègre pendant cette période une équipe de recherche. Sous le contrôle d’un tuteur pédagogique, l'étudiant s’initiera au travail quotidien d’un chercheur en suivant les travaux d’une équipe de recherche. Un projet pédagogique simple avec des objectifs à court-terme lui sera proposé afin de se familiariser avec une méthode et/ou une technique parmi celle utilisées dans le domaine. Ce stage pourra aussi être constitué par un travail bibliographique.

Objectifs en termes de compétences

  • Se forger une vision des problématiques et de défis de la discipline,
  • S’initier et découvrir la pensée et la démarche scientifique : les moyens humains et techniques pour répondre à une question biologique,
  • Découvrir les laboratoires associés au master. Utiliser les méthodes et les techniques les plus performantes,
  • Appréhender la vie quotidienne d’une équipe de recherche,
  • Apprendre à travailler en équipe,
  • Développer un regard critique sur un article de recherche,
  • Apprendre à écrire et à structurer un rapport, à tenir un cahier de laboratoire, à faire une présentation orale.

Le contrôle des connaissances du stage en laboratoire

  • un rapport écrit. A rendre pour avril 2019
  • une présentation orale( en mai 2019)
    1. exposé oral
    2. réponses aux questions