Stage M2S3 (2019-2020)

Récemment, il a été montré que le complexe responsable des coupures double-brin lors de l’initiation de la recombinaison méiotique chez les plantes et les métazoaires possède une architecture ressemblant fortement à la topoisomérase VI (Robert et al., 2016). En effet, la protéine TOPOVIBL [topoisomérase VIB-like ou meiotic topoisomerase VIB (MTOPVIB)] est un homologue structural de la sous-unité B de la topoisomérase VI. Elle forme un complexe avec deux homologues de la sous-unité A (Spo11-1 et -2) et est essentielle pour la formation de coupures double-brin lors de la méiose (Hartung et al., 2007).
Chez les plantes, une analyse des séquences de TOPOVIBL, plus particulièrement de leur CTD (C-terminal domain), montre que celles-ci peuvent se diviser en deux groupes phylogénétiques distincts. Afin de mettre en place une étude de génomique comparative de l’initiation de la recombinaison méiotique chez les plantes, des analyses de séquences d’autres protéines de cassure sont nécessaires. L’objectif du stage consiste en l’analyse de séquences des protéines DFO seulement trouvées chez les plantes, de PRD2 (correspondant à Mei4 chez Saccharomyces cerevisiae et les mammifères), de PRD3 qui pourrait correspondre à Mer2, et de PRD1 (correspondant à Mei1 chez la souris).