Bonjour,

Merci de déposer votre proposition de stage pour le M2S4 BSIB 2016-2017.

Le stage se déroulera de janvier à juin. La soutenance est prévue vers le 12-15 juin.

Responsable de l'équipe d'accueil

CAVARELLI
JEAN
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03 69 48 52 74

Personne encadrant le stage

CAVARELLI
JEAN
03 69 48 52 74

Lieu du stage

IGBMC

Sujet du stage

Etude structurale et fonctionnelle de la famille des Protéine-Arginine-N-methyltransférases. Des structures 3D vers la conception rationnelle de composés à action pharmacologique
Les modifications post-traductionnelles sont des signaux moléculaires qui régulent de nombreux processus biologiques fondamentaux pour la vie cellulaire. L'un des axes principaux de recherche de l'équipe d'accueil concerne l'étude de la méthylation des arginines, une modification post-traductionnelle très courante chez les eucaryotes. Cette fonction est assurée par les protéines arginine méthyl transférases (PRMT). Les PRMT sont des protéines régulatrices de plusieurs mécanismes cellulaires vitaux (transcription et traduction de l'information génétique, réparation de l'ADN et maturation des ARN) et font l'objet de nombreuses études structurales et fonctionnelles.
Au moins 10 PRMT ont été identifiées chez l'humain et cette famille de
protéines a été divisée en quatre classes selon la nature chimique des arginines modifiées (PRMT de type I à IV). Les PRMT sont des protéines modulaires, contenant de 320 à 970 acides aminés, construites autour d'un domaine catalytique commun avec des domaines supplémentaires conférant une spécificité structurale et fonctionnelle à chacune des PRMT. Le domaine catalytique des PRMT de type I est maintenant relativement bien caractérisé à l'échelle structurale alors qu'une seule structure de PRMT de type II est connue à ce jour.
De nombreux travaux ont montré que des dérégulations des processus cellulaires impliquant les PRMT pouvant induire certains cancers, les PRMT constituent aussi une des nouvelles cibles potentielles en chimiothérapie. La découverte d'inhibiteurs spécifiques des PRMT pourrait donc ouvrir des voies thérapeutiques nouvelles. La compréhension à l'échelle atomique du mode d'action des PRMT s'avère donc cruciale à la fois au niveau fondamental et pour des applications pharmacologiques.

Le projet de stage proposé s'insere dans les travaux de l'équipe et porte sur la découverte de nouveaux modulateurs de PRMT par un processus de "structure based drug design".

Modalités de l’évaluation de l’UE « Stage expérimentale en laboratoire » de la mention de Master Sciences du Vivant

L’UE « stage expérimentale en laboratoire » se compose de 3 blocs pédagogiques de même coefficient : un rapport écrit (coefficient 8), une soutenance orale (coefficient 10) et une épreuve de réponses aux questions (coefficient 12).

Le jury est constitué de 5 membres au moins dont le responsable de la spécialité de Master. Des sous-jurys (par parcours) de 5 membres au moins dont un représentant du responsable de la spécialité de Master peuvent être constitués. Chaque rapport sera examiné par au moins 2 rapporteurs et 3 dans la mesure du possible. Les rapporteurs font partie du jury. Chaque rapporteur évaluera au minimum 3 rapports.

L’avis du maître de stage sera demandé sous forme d’un questionnaire standard et pourra être pris en compte par le président du jury lors de l’établissement de la note finale.
 

Rapport écrit (coefficient 8) 
 

Il a pour but d’évaluer les compétences de l’étudiant à rédiger un rapport scientifique écrit tant sur le fond que sur la forme. Les candidats seront jugés sur la cohérence de la démarche scientifique et sur l’enchaînement logique du travail plus que sur les résultats eux-mêmes. Il est rappelé que l'essentiel du travail exposé dans le mémoire doit représenter le travail effectif qu'a réalisé l'étudiant durant son semestre de stage.

Les candidats remettront 5 exemplaires papier du rapport de stage et une version informatique (format PDF), courrier adressé à Pr. Jean Cavarelli, date limite de réception sera communiqué aux étudiants.

La version PDF devra être déposée sur le site moodle UNISTRA, rubrique stage M2S4 BSIBB, tout au début du mois de juin (la date sera communiquée aux étudiants (1er juin en 2017). Les versions PDF et papier devront être identiques.

  • Toutes les parties du document seront rédigées en interligne de 1,5 en utilisant une police de type Times et des caractères de taille 12.
    Le rapport écrit devra obligatoirement comporter les parties suivantes : introduction, Matériels et Méthodes, Résultats, Discussion / Perspectives et n’excèdera pas 20 pages numérotées. Les pages seront imprimées en recto simple.
  • L’ensemble figures, tableaux, bibliographie ne dépassera pas 10 pages supplémentaires (non paginées). Les figures et leur légende sont présentées en regard du texte (Figures au verso, texte au recto de la page suivante). Les légendes des figures doivent permettre de comprendre les figures sans avoir besoin de consulter le texte, tout en évitant une trop grande redondance avec le texte.
  • Les modalités de présentation de la bibliographie sont celles de la revue CELL (revue généraliste dans laquelle les références sont indiquées dans le texte à l'aide des auteurs et de l'année de publication). Elles peuvent être retrouvées en utilisant un logiciel de type EndNote .
  • Le document sera complété par une page de sommaire et une page d’abréviations en début de rapport.
  • Chaque mémoire doit être accompagné d’un résumé d’une page au maximum (police type Times caractère taille 12, interligne 1,5). Ce résumé doit être suffisamment informatif pour permettre d'orienter le choix des rapporteurs qui examineront le manuscrit. Il devra comporter les informations suivantes :
    Nom et prénom du candidat : Spécialité de Master :
    Laboratoire d'accueil :
    Responsable du stage :
    Titre du rapport
    Mots clés ………………….
    Résumé .............................

 

Présentation orale : durée 12 mn (coefficient 10) 
 

Les soutenances auront lieu mi-juin. La date sera précisé au cours du semestre. Elle a pour but d’évaluer sur la forme et sur le fond les compétences des étudiants à exposer dans un temps limité un travail expérimental, à le situer dans son contexte et à en discuter la stratégie
expérimentale, les résultats et les perspectives. Le candidat devra déposer déposera une version pdf de son exposé oral sur le site moodle du stage la date sera communiquée aux étudiants (13 et 14 juin en 2017). 


Entretien avec les membres du jury.
Questions : durée 12 mn (coefficient 12) 
 

Les questions visent à évaluer et à préciser les connaissances de l‘étudiant sur le thème abordé, son esprit critique et ses compétences expérimentales. Elles pourront ainsi porter sur les techniques mises en œuvre, leur principe, la culture générale dans le domaine abordé et plus généralement la capacité à analyser les résultats et à en dégager des perspectives.


Les questions pourront s’appuyer sur l’exposé oral et sur le manuscrit. Dans ce dernier cas, elles concerneront le fond et non la forme (orthographe, mise en page , etc …)