Stage M2S4 (2019-2020)
Bonjour,
Merci de déposer votre proposition de stage pour le M2S4 BSIB 2019-2020.
Le stage se déroulera de janvier à juin 2020. La soutenance est prévue vers le 15 juin 2020.
Responsable de l'équipe d'accueil
Personne encadrant le stage
Lieu du stage
Équipe Biointerfaces – Directrice Dr. Karine Anselme, DR CNRS.
15 rue Jean Starcky, B.P. 2488 – 68057 Mulhouse Cedex, France – Université de Haute Alsace (UHA).
Sujet du stage
Les pathologies affectant le muscle squelettique, qu’elles soient d’origine génétique (maladies neuromusculaires congénitales), traumatique (lésions de la moelle épinière) ou liées au vieillissement (sarcopénie ou fonte musculaire) entraînent des dysfonctionnements moteurs invalidants. L’étude de certains aspects de la physiologie des cellules musculaires squelettiques nécessite le développement de techniques d’ingénierie de surface des matériaux, en vue de contrôler la position, la morphologie, la migration, l’excitation et la contraction de cellules cultivées sur ces supports. L’objectif de ce projet est la fonctionnalisation de surfaces de polymères avec des nanoparticules, les pseudo-particules virales (virus-like particles, VLP), utilisées comme plateformes préfabriquées pour le contrôle spatial des cellules musculaires squelettiques en culture. Les VLP, du fait de leur taille (20-200 nm), leur biocompatibilité, leur géométrie de surface répétitive et leur polyvalence, ont déjà été utilisées pour présenter à leur surface des antigènes reconnus par les cellules du système immunitaire (stratégies vaccinales), pour encapsuler des molécules thérapeutiques, mais aussi pour générer des nano-plateformes biologiques dans des applications diverses (Ding et al., 2018). Des VLP ont été fonctionnalisées par couplage chimique sur des sites spécifiques en surface, ou par génie génétique pour présenter des antigènes ou des ligands à leur surface.
Dans ce projet de M2, le stagiaire ① produira par clonage moléculaire des VLP recombinantes exposant à leur surface des ligands ayant une affinité pour les cellules musculaires, ② purifiera ces VLP produites dans des cultures bactériennes, ③ couplera ces VLP à la surface de polymères, ④ cultivera des cellules musculaires sur ces surfaces fonctionnalisées et ⑤ analysera les résultats à l’aide de l’imagerie fluorescente confocale. Les résultats obtenus ouvriront la voie au développement de nouveaux microsystèmes contrôlés, composés de biomatériaux activables, pour l’étude de la physiopathologie des cellules musculaires.
Référence : Ding X, Liu D, Booth G, Gao W, Lu Y. Virus-Like Particle Engineering: From Rational Design to Versatile Applications. Biotechnol J. 2018 May;13(5):e1700324. Review.
Modalités de l’évaluation de l’UE « Stage expérimentale en laboratoire » de la mention de Master Sciences du Vivant
L’UE « stage expérimentale en laboratoire » se compose de 3 blocs pédagogiques de même coefficient : un rapport écrit (coefficient 8), une soutenance orale (coefficient 10) et une épreuve de réponses aux questions (coefficient 12).
Le jury est constitué de 5 membres au moins dont le responsable de la spécialité de Master. Des sous-jurys (par parcours) de 5 membres au moins dont un représentant du responsable de la spécialité de Master peuvent être constitués. Chaque rapport sera examiné par au moins 2 rapporteurs et 3 dans la mesure du possible. Les rapporteurs font partie du jury. Chaque rapporteur évaluera au minimum 3 rapports.
L’avis du maître de stage sera demandé sous forme d’un questionnaire standard et pourra être pris en compte par le président du jury lors de l’établissement de la note finale.
Rapport écrit (coefficient 8)
Il a pour but d’évaluer les compétences de l’étudiant à rédiger un rapport scientifique écrit tant sur le fond que sur la forme. Les candidats seront jugés sur la cohérence de la démarche scientifique et sur l’enchaînement logique du travail plus que sur les résultats eux-mêmes. Il est rappelé que l'essentiel du travail exposé dans le mémoire doit représenter le travail effectif qu'a réalisé l'étudiant durant son semestre de stage.
Les candidats remettront 4 exemplaires papier du rapport de stage et une version informatique (format PDF), courrier adressé à Pr. Jean Cavarelli, date limite de réception sera communiqué aux étudiants.
La version PDF devra être déposée sur le site moodle UNISTRA, rubrique stage M2S4 BSIBB, tout au début du mois de juin (la date sera communiquée aux étudiants (début juin en 2020). Les versions PDF et papier devront être identiques.
- Toutes les parties du document seront rédigées en interligne de 1,5 en utilisant une police de type Times et des caractères de taille 12.
Le rapport écrit devra obligatoirement comporter les parties suivantes : introduction, Matériels et Méthodes, Résultats, Discussion / Perspectives et n’excèdera pas 20 pages numérotées. Les pages seront imprimées en recto simple. - L’ensemble figures, tableaux, bibliographie ne dépassera pas 10 pages supplémentaires (non paginées). Les figures et leur légende sont présentées en regard du texte (Figures au verso, texte au recto de la page suivante). Les légendes des figures doivent permettre de comprendre les figures sans avoir besoin de consulter le texte, tout en évitant une trop grande redondance avec le texte.
- Les modalités de présentation de la bibliographie sont celles de la revue CELL (revue généraliste dans laquelle les références sont indiquées dans le texte à l'aide des auteurs et de l'année de publication). Elles peuvent être retrouvées en utilisant un logiciel de type EndNote .
- Le document sera complété par une page de sommaire et une page d’abréviations en début de rapport.
- Chaque mémoire doit être accompagné d’un résumé d’une page au maximum (police type Times caractère taille 12, interligne 1,5). Ce résumé doit être suffisamment informatif pour permettre d'orienter le choix des rapporteurs qui examineront le manuscrit. Il devra comporter les informations suivantes :
Nom et prénom du candidat : Spécialité de Master :
Laboratoire d'accueil :
Responsable du stage :
Titre du rapport
Mots clés ………………….
Résumé .............................
Présentation orale : durée 12 mn (coefficient 10)
Les soutenances auront lieu mi-juin. La date sera précisé au cours du semestre. Elle a pour but d’évaluer sur la forme et sur le fond les compétences des étudiants à exposer dans un temps limité un travail expérimental, à le situer dans son contexte et à en discuter la stratégie
expérimentale, les résultats et les perspectives. Le candidat devra déposer déposera une version pdf de son exposé oral sur le site moodle du stage la date sera communiquée aux étudiants (mi-juin en 2020).
Entretien avec les membres du jury. Questions : durée 12 mn (coefficient 12)
Les questions visent à évaluer et à préciser les connaissances de l‘étudiant sur le thème abordé, son esprit critique et ses compétences expérimentales. Elles pourront ainsi porter sur les techniques mises en œuvre, leur principe, la culture générale dans le domaine abordé et plus généralement la capacité à analyser les résultats et à en dégager des perspectives.
Les questions pourront s’appuyer sur l’exposé oral et sur le manuscrit. Dans ce dernier cas, elles concerneront le fond et non la forme (orthographe, mise en page , etc …)
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