Stage M2S4 (2019-2020)
Bonjour,
Merci de déposer votre proposition de stage pour le M2S4 BSIB 2019-2020.
Le stage se déroulera de janvier à juin 2020. La soutenance est prévue vers le 15 juin 2020.
Responsable de l'équipe d'accueil
Personne encadrant le stage
Lieu du stage
Équipe Biointerfaces – Directrice Dr. Karine Anselme, DR CNRS.
15 rue Jean Starcky, B.P. 2488 – 68057 Mulhouse Cedex, France – Université de Haute Alsace (UHA).
Sujet du stage
Portés par 400 000 patientes en France, les implants mammaires sont des dispositifs à visée médicale (reconstruction ou traitement de malformation congénitale) ou esthétique, régulièrement mis en cause dans des scandales sanitaires hautement médiatisés. En avril 2019, 18 ans après les prothèses PIP (2001), les implants dits « macrotexturés » sont retirés du marché français par l’ANSM car potentiellement inductibles d’une forme rare de cancer, un lymphome à grandes cellules associé aux implants mammaires (LAGC-AIM).
Les prothèses les plus texturées ont été développées pour favoriser l’adhésion des tissus endommagés suite à une ablation des seins et la stabilisation de l’implant. La capsule fibreuse périprothétique que l’organisme hôte met en place pour isoler ce corps étranger peut répondre à cette texturation par une réaction inflammatoire chronique susceptible de dériver en diverses pathologies (contracture capsulaire, lymphome).
Un travail collaboratif mené avec notre laboratoire a permis d’élaborer une nouvelle classification des implants basée sur le degré de la topographie de surface. Cette classification a été validée d’un point de vue biologique et a montré que les profils d’expression de gènes candidats liés à l’inflammation ou au remodelage de la matrice extracellulaire étaient différents dans des tissus sains en contact avec des SOC (implants les plus texturés) en comparaison aux 2 autres types de texturation (PV et OC).
Dans ce contexte, ce projet de M2 vise à exploiter une banque de capsules saines et pathologiques, afin de déterminer si d’autre(s) paramètre(s) corrèlent d’une part avec les données cliniques, et d’autre part avec des modifications précoces de l’expression génique de marqueurs d’intérêt (inflammation, remodelage de la matrice extracellulaire) et leur corrélation au niveau protéique.
Ce projet permettra à l’étudiant(e) sélectionné(e) d’acquérir des techniques et des compétences en biologie moléculaire et biochimie: ① lyse de tissus fibreux, ② extraction des ARN totaux et check-points (électrophorèse, Nanodrop), ③ rétro-transcription (ARN en ADNc) / PCR semi-quantitative, ④ analyse des données générées et ⑤ extraction de protéines et western-blot.
Référence : Brigaud et al., 2019. PRS. In revision.
Modalités de l’évaluation de l’UE « Stage expérimentale en laboratoire » de la mention de Master Sciences du Vivant
L’UE « stage expérimentale en laboratoire » se compose de 3 blocs pédagogiques de même coefficient : un rapport écrit (coefficient 8), une soutenance orale (coefficient 10) et une épreuve de réponses aux questions (coefficient 12).
Le jury est constitué de 5 membres au moins dont le responsable de la spécialité de Master. Des sous-jurys (par parcours) de 5 membres au moins dont un représentant du responsable de la spécialité de Master peuvent être constitués. Chaque rapport sera examiné par au moins 2 rapporteurs et 3 dans la mesure du possible. Les rapporteurs font partie du jury. Chaque rapporteur évaluera au minimum 3 rapports.
L’avis du maître de stage sera demandé sous forme d’un questionnaire standard et pourra être pris en compte par le président du jury lors de l’établissement de la note finale.
Rapport écrit (coefficient 8)
Il a pour but d’évaluer les compétences de l’étudiant à rédiger un rapport scientifique écrit tant sur le fond que sur la forme. Les candidats seront jugés sur la cohérence de la démarche scientifique et sur l’enchaînement logique du travail plus que sur les résultats eux-mêmes. Il est rappelé que l'essentiel du travail exposé dans le mémoire doit représenter le travail effectif qu'a réalisé l'étudiant durant son semestre de stage.
Les candidats remettront 4 exemplaires papier du rapport de stage et une version informatique (format PDF), courrier adressé à Pr. Jean Cavarelli, date limite de réception sera communiqué aux étudiants.
La version PDF devra être déposée sur le site moodle UNISTRA, rubrique stage M2S4 BSIBB, tout au début du mois de juin (la date sera communiquée aux étudiants (début juin en 2020). Les versions PDF et papier devront être identiques.
- Toutes les parties du document seront rédigées en interligne de 1,5 en utilisant une police de type Times et des caractères de taille 12.
Le rapport écrit devra obligatoirement comporter les parties suivantes : introduction, Matériels et Méthodes, Résultats, Discussion / Perspectives et n’excèdera pas 20 pages numérotées. Les pages seront imprimées en recto simple. - L’ensemble figures, tableaux, bibliographie ne dépassera pas 10 pages supplémentaires (non paginées). Les figures et leur légende sont présentées en regard du texte (Figures au verso, texte au recto de la page suivante). Les légendes des figures doivent permettre de comprendre les figures sans avoir besoin de consulter le texte, tout en évitant une trop grande redondance avec le texte.
- Les modalités de présentation de la bibliographie sont celles de la revue CELL (revue généraliste dans laquelle les références sont indiquées dans le texte à l'aide des auteurs et de l'année de publication). Elles peuvent être retrouvées en utilisant un logiciel de type EndNote .
- Le document sera complété par une page de sommaire et une page d’abréviations en début de rapport.
- Chaque mémoire doit être accompagné d’un résumé d’une page au maximum (police type Times caractère taille 12, interligne 1,5). Ce résumé doit être suffisamment informatif pour permettre d'orienter le choix des rapporteurs qui examineront le manuscrit. Il devra comporter les informations suivantes :
Nom et prénom du candidat : Spécialité de Master :
Laboratoire d'accueil :
Responsable du stage :
Titre du rapport
Mots clés ………………….
Résumé .............................
Présentation orale : durée 12 mn (coefficient 10)
Les soutenances auront lieu mi-juin. La date sera précisé au cours du semestre. Elle a pour but d’évaluer sur la forme et sur le fond les compétences des étudiants à exposer dans un temps limité un travail expérimental, à le situer dans son contexte et à en discuter la stratégie
expérimentale, les résultats et les perspectives. Le candidat devra déposer déposera une version pdf de son exposé oral sur le site moodle du stage la date sera communiquée aux étudiants (mi-juin en 2020).
Entretien avec les membres du jury. Questions : durée 12 mn (coefficient 12)
Les questions visent à évaluer et à préciser les connaissances de l‘étudiant sur le thème abordé, son esprit critique et ses compétences expérimentales. Elles pourront ainsi porter sur les techniques mises en œuvre, leur principe, la culture générale dans le domaine abordé et plus généralement la capacité à analyser les résultats et à en dégager des perspectives.
Les questions pourront s’appuyer sur l’exposé oral et sur le manuscrit. Dans ce dernier cas, elles concerneront le fond et non la forme (orthographe, mise en page , etc …)
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