Stage Master

Les éléments transposables peuvent constituer une part importante des génomes chez les Métazoaires (près de la moitié du génome humain). Ils constituent des éléments clés de la plasticité génomique. Chez les Insectes, le contenu en éléments transposables apparait très variable suivant les espèces considérées et contribuent grandement aux variations de taille de génomes observées (WU & Lu, Genes, 2019). En revanche, on ne dispose encore que de peu de données sur les éléments transposables chez les Crustacés.

L’objectif du stage est de constituer un ensemble de référence de ces éléments répétés chez les Crustacés afin d’étudier leur évolution. Pour cela, il conviendra dans un premier temps de recenser les transposons déjà décrits dans la littérature et les bases de données. Dans un deuxième temps, les génomes et transcriptomes de quelques espèces représentatives de Crustacés seront explorés pour rechercher de nouveaux transposons. Les contenus en transposons connus et nouveaux des espèces ciblées seront ensuite comparés afin de caractériser l’évolution des transposons chez les Crustacés et l’impact de ces derniers sur les caractéristiques génomiques.