Stage Master

L’alignement multiple de séquences (MSA) est une technique essentielle en bioinformatique pour caractériser une famille de protéines et distinguer les régions conservées / divergentes. Néanmoins, à l’ère du séquençage génomique à très haut débit, les bases de données publiques sont inondées de de séquences protéiques mal-prédites contenant des insertions, des délétions ou des mismatchs erronés.

Dans ce contexte, l’équipe CTSB développe des outils basés sur des approches basés sur l’apprentissage profond pour analyser un alignement multiple de séquences et identifier les erreurs potentiels. L’objectif du stage est de préparer des jeux de données pour les différentes étapes d’apprentissage et d’évaluation, d’implémenter des outils de conversion des entrées / sorties et d’estimer la qualité des prédictions d’erreur.