Responsable de l'équipe d'accueil

Kieffer
Bruno
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0368854722

Personne encadrant le stage

0368854722

Lieu du stage

IGBMC

Sujet du stage

Etude de l'interaction entre des peptides polyproline et un domaine SH3 par RMN du Fluor
Les prolines jouent un role important dans les mécanismes de régulation de l'expression des gènes. Ces résidus sont par exemple impliqués dans le code épigénétique, ou dans de nombreuses cascades de signalisation. Les mécanismes associés aux prolines sont encore mal compris car ils reposent sur les propriétés dynamiques de cet acide aminé. L'équilibre entre les formes cis et trans par exemple est modulé par des isomérases dans de nombreux mécanismes de régulation. Le projet consiste à exploiter la RMN du fluor pour obtenir les paramètres cinétiques de l'interaction entre des peptides modèles polyproline et un domaine SH3 appartenant à un co-régulateur du récepteur de l'acide rétinoique. Le stage comprendra la production d'échantillons, l'acquisition des spectres RMN ainsi que la mise en place de nouveaux outils numériques pour l'analyse et l'interprétation des données.

refs:
Lalevée S, Bour G, Quinternet M, Samarut E, Kessler P, Vitorino M, Bruck N, Delsuc MA, Vonesch JL, Kieffer B, Rochette-Egly C. (2010) Vinexin{beta}, an atypical "sensor" of retinoic acid receptor {gamma} signaling: union and sequestration, separation, and phosphorylation. FASEB 24, 4523−4534.