Responsable de l'équipe d'accueil

Cavarelli
Jean
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03 69 48 52 74

Personne encadrant le stage

Bonnefond
Luc
03 69 48 52 73

Lieu du stage

IGBMC
Département de Biologie Structurale Intégrative
Equipe de Biologie Structurale des Cibles Epigénétiques
1 rue Laurent Fries
BP 10142
F - 67404 ILLKIRCH CEDEX

Sujet du stage

Protéines arginines méthyltransférases : régulation, spécificité et reconnaissances des substrats
Les protéines arginine méthyl transférases (PRMT) sont impliquées dans des processus cellulaires variés comme la transcription, la traduction, la transduction du signal, la maturation et le transport des ARN, la réparation de l'ADN et l'apoptose. Des substrats de PRMTs ont d’abord été identifiés parmi des histones, puis des facteurs de transcription ou d’épissage et des protéines liant l’ARN. Neuf PRMTs ont été identifiées chez l’homme, quatre chez la levure et plusieurs chez des mouches, poissons, plantes et vers. Quatre types (I à IV) de PRMT ont été caractérisés en fonction du nombre et de la position des méthylations sur le résidu arginine modifié. Le Type IV n’a pour l’instant été identifié que chez la levure avec la protéine RMT2 et le rôle de cette méthylation spécifique n’a pas encore été élucidé.

Le stage s'inscrira dans cette problématique où l’investissement de notre équipe est important depuis de nombreuses années (études structurales et fonctionnelles de PRMT2, PRMT4, PRMT6, PRMT7 et PRMT9). Le stage s'intégrera dans les travaux de l'équipe d'accueil, avec 2 aspects : (1) étude structurale et fonctionnelle de RMT2 de levure, seule ou en présence de substrats (co-facteurs et peptides isolés); (2) étude de complexes impliquant RMT2.

Plusieurs domaines d’expertises seront abordés au cours du stage : biologie moléculaire (clonage, expression, purification et méthodes biophysiques de caractérisations), biochimie (tests d’activité) et études structurales à différentes échelles de résolution (bio-cristallographie, SAXS, cryo-EM). Un goût pour le travail expérimental et une capacité de travail en équipe dans un environnement pluridisciplinaire sont demandés.