Stage Master

Dans le cadre d’études de génomique des populations, les levures, et en particulier Saccharomyces cerevisiae représentent des modèles de choix. Ces micro-organismes disposent en effet de génomes petits et compacts, qui permettent un séquençage aisé et à cout abordable. Ils sont de plus faciles à manipuler au laboratoire, permettant de réaliser des phénotypages à haut-débit par exemple.
Le stage s’inscrira dans un projet dans le cadre duquel le séquençage d’un grand nombre d’isolats a été réalisé avec la technologie Oxford Nanopores. Les données générées ont permis de construire des assemblages de génomes de très grande qualité, sur la base desquels la variabilité génétique peut à présent être explorée. Nous souhaitons en particulier obtenir une vue exhaustive des variants structuraux au sein de cette espèce, données qui pourront ensuite être confrontées aux différences phénotypiques observées entre ces mêmes isolats, de manière à mieux comprendre les liens génotype/phénotype au sein de cette espèce.