Stage Master

Les facteurs de transcription (TF) caractérisés par un doigt de zinc binucléaire de type Zn2Cys6 sont spécifiques aux mycètes et abondants (plus de 120 000 séquences). Ils constituent des régulateurs majeurs de nombreux processus biologiques critiques au sein des champignons, y compris chez les pathogènes de l'homme, des animaux et des plantes. Sur la base de l'analyse des séquences, nous avons identifié et caractérisé une nouvelle famille de TF à Zn2Cys6, appelée famille CeGAL (pour Cep3 à GAL4, 2 membres bien étudiés) que nous proposons comme cibles potentielles pour le développement de nouvelles stratégies de traitement antifongique. Cette famille comprend environ 60 000 protéines partageant une faible identité de séquences mais une organisation en domaines commune.

En utilisant des stratégies et des logiciels internes originaux, nous avons construit un alignement multiple des séquences complètes de plus de 2 500 séquences CeGAL, incluant les séquences d’orthologues représentatifs et diversifiés des 43 CeGAL de S. cerevisiae.
L’objectif du stage est de fournir une analyse intégrée des données de séquence et de structure de ces 43 membres de la famille CeGAL, en exploitant plus particulièrement les données tridimensionnelles fournies récemment par AlphaFold DB.