Stage Master

La PKR est une protéine kinase devant reconnaître des acides nucléqiues pour s'autophosphoryler pour transduire son signal. Elle est connue principalement pour interagir avec des ARN double-brin viraux ce qui permet la phosphorylation du facteur d'élongation eIF2alpha qui réprime la traduction ce qui est essentiel pour éviter la production virale.
Mais la PKR ne reconnait pas que des substrats viraux. Des études récentes indiquent qu'elle est capable d'interagir avec plusieurs ARN cellulaires et notamment des ARN mitochondriaux. La PKR serait donc aussi impliquer dans le dialogue entre le noyau et la mitochondrie. La PKR reconnait également la région 3' UTR du messager du facteur de nécrose tumorale (Tumor Necrosis Factor, TNF). Nous avons récemment publié une étude qui nous permet de mieux comprendre les bases structurales de la reconnaissance des ARN par la PKR. Le but de ce stage est de dresser un bilan des connaissances sur les substrats ARN de la PKR et d'en dégager des déterminants structuraux. Le stage M2S4 relié consistera à tenter de cristalliser la 3' UTR du messager du TNF qui permet l'interaction.