Stage Master

Le stage consistera à tenter de résoudre par radiocristallographie la structure de la région 3' UTR du messager du Facteur de Nécrose Tumorale (Tumor Necrosis Factor, TNF) reconnue par la protéine kinase ARN-dépendante (PKR), une kinase importante dans le stress cellulaire. Cette région d'environ 100 nucléotides adopte une structure particulière reconnue par la PKR qui s'autophosphoryle alors et transduit son signal notamment en phosphorylant le facteur de traduction eIF2alpha. Pour cela nous étudierons les caractéristiques de repliement des différentes séquences de cette région que nous avons étudiées dans notre publication récentes (Namer et al. Cell Report (2017), 20, 188-200). Nous étudierons le repliement des différents ARN par des méthodes biochimiques et spectroscopiques et nous cristalliserons celles dont les conformations apparaitront comme les plus stables. Nous tenterons également de cristalliser les ARN en présence de la PKR.